Bonjour,
L'administration n'est pas enfermée dans un délai spécifique pour produire sa "réponse aux observations du contribuable", sauf cas spécifiques touchant principalement les sociétés. Elle dispose donc du délai de droit commun de 4 ans à compter de son dernier acte de procédure pour vous répondre (la proposition de rectification dans votre cas j'imagine).
Elle n'était donc pas, a priori, hors délai.
Ceci dit, un délai de réponse aussi long peut être révélateur d'un dossier "compliqué" pour l'Administration, ou d'un simple problème de gestion administrative (changement du vérificateur ou de son supérieur par exemple).
Espérant avoir répondu à vos interrogations,
GV